PhysChem Suite LogD

用ACD / LogD计算分配系数

LogD Overview

根据结构预测分配系数

ACD / LogD可根据结构预测辛醇-水的分配系数(或表观分配系数)
使用ACD / LogD可以:

Benefits

LogD属性计算器中需要的一切

快速,准确和可靠

更深入的见解

几合一计算器

使用内部数据可自定义

How it Works

LogD的快速预测

1绘制/导入结构
2查看结果并做出决定
3报告为PDF或复制/粘贴结果

Product Features

分配系数(LogD)计算器功能

  • 根据结构预测logD(在应用程序内绘制,或从第三方图形包复制/粘贴); SMILES字符串; InChI代码;导入的MOL,SK2,SKC或CDX文件;或在内置字典中按名称搜索
  • 从多种logP和pKa算法中选择(默认值:logP共识,pKa经典)
  • 查看不同pH值的logD
    • 生理相关值(1.7,4.6,6.5,7.4,8.0)
    • 在感兴趣的pH值上单击并拖动以绘制logD(logD与pH)
    • 在特定的pH值上添加/删除预测
  • 计算化合物组或化合物库的logD属性,并使用内置工具对结果进行排序,过滤,绘图和排名。
    • 设置用户定义的标签颜色
    • 数字过滤结果
    • 按升序/降序对结果进行排序
  • 查看历史记录中先前计算的值的结果
  • 将结果报告为PDF
  • 使用logP和pKa的实验值训练模型,以改善对专有化学空间的预测chemical space
    • 创建并选择不同的训练库进行计算,或切换到内置算法

Deployment/Integration Options

选择适合您的部署选项

桌面版

在单台计算机上安装ACD / pKa以访问客户端,该客户端提供完整的图形用户界面和算法训练工具的访问权限

批量版

用最少的用户干预即可计算成千上万种化合物的pKa。批处理部署与Microsoft Windows和Linux操作系统(OS)兼容。企业内部网或工作流工具(例如Pipeline Pilot)的插件。

Percepta Portal网页版

使用基于浏览器的应用程序来预测pKa。可以使用KNIME集成组件。托管在您的公司Intranet或云上。适用于Linux和Windows OS。

More Reasons to Use LogD

有关分配系数预测的技术信息

可训练的LogD计算器

通过训练底层的logP和pKa模型来训练logD算法。提高预测精度并扩大模型在新型化学空间中的适用性。

如何计算logD值?

分布系数(logD)是两相(辛醇和水性缓冲液)的每相中所有形式的化合物(中性和离子化)的所有浓度之和的比率。每种形式在水性缓冲液和正辛醇之间分配的趋势不同。其特征在于与pH无关的分配系数logP物种(例如,logP0,logP-,logP2 +等)。

logD预测算法基于logP的碎片算法(中性形式)和一系列校正因子来计算分配常数,同时考虑电离的类型和位置。 LogD是所有分子种类分布的函数,由pKa预测的pH值控制.

ACD / LogD提供了各种用于预测logP和pKa值的算法,并且可以选择(并将它们的默认组合)用于预测logD

有关LogD的一般信息

什么是分配系数?

分布常数(D),也称为表观分配系数,是可电离分子的亲水性(“偏爱水”)或疏水性(“偏怕水”)的量度。它代表了化合物在两个不混溶相(通常是辛醇和水性缓冲液)中差异溶解的趋势,同时考虑了基于pH值的离子化物质的分布。也称为分布系数。例如,请参见甲胺在辛醇-水中的分配以及分布常数如何描述该分配:

LogD预测模型将分布常数估计为对数比(logD或ClogD)。分布系数充当可电离化合物的亲脂性(或疏水性)的定量描述。

如何使用logD值?

药物发现-LogD值用于了解和预测活性化合物在生理条件下的体内行为。由于整个胃肠道的pH环境差异很大(从胃中的1.4到结肠中的8),了解药物在生理条件下的亲脂性/亲水性有助于科学家了解在实质上不同的化学环境下的行为。

LogD值在色谱方法开发中也很重要(用于选择合适的pH和分离柱);在农业化学中开发除草剂和杀虫剂;在环境化学中了解污染物的行为,并在许多其他消费产品的开发中。

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