LogD Overview
根据结构预测分配系数
ACD / LogD可根据结构预测辛醇-水的分配系数(或表观分配系数)
使用ACD / LogD可以:
- 计算各种pH下有机分子的所有化合物种类的分布系数值(logD)
- 查看与生理相关的pH值或感兴趣的离散pH值的logD结果
- 用logP和pKa的实验测量值训练算法
Benefits
LogD属性计算器中需要的一切
快速,准确和可靠
- pKa和logP的行业标准计算器为准确logD计算提供了基础
- 利用所提供的信息评估结果的准确性-可靠性指标,数据库中五个最相似的结构以及原始实验数据的文献参考
更深入的见解
- 通过自动生成的logD与pH的关系图了解分子的行为
- 轻松创建散点图,浏览,过滤,排序,排序和优先化化合物
几合一计算器
- G通过更改logP和pKa预测算法的组合来预测logD,可以获得几个logD值。从三种logP算法(经典,GALAS和共识)和两种pKa算法(经典和GALAS)中进行选择。
使用内部数据可自定义
- 从商业产品获得内部模型的准确性。使用实验测得的logP和pKa值将适用范围扩展到专有化学空间。
- 为每个项目建立一个培训集,以提高准确性
Previous
Next
1绘制/导入结构
2查看结果并做出决定
3报告为PDF或复制/粘贴结果
Product Features
分配系数(LogD)计算器功能
- 根据结构预测logD(在应用程序内绘制,或从第三方图形包复制/粘贴); SMILES字符串; InChI代码;导入的MOL,SK2,SKC或CDX文件;或在内置字典中按名称搜索
- 从多种logP和pKa算法中选择(默认值:logP共识,pKa经典)
- 查看不同pH值的logD值
- 生理相关值(1.7,4.6,6.5,7.4,8.0)
- 在感兴趣的pH值上单击并拖动以绘制logD(logD与pH)
- 在特定的pH值上添加/删除预测
- 计算化合物组或化合物库的logD属性,并使用内置工具对结果进行排序,过滤,绘图和排名。
- 设置用户定义的标签颜色
- 数字过滤结果
- 按升序/降序对结果进行排序
- 查看历史记录中先前计算的值的结果
- 将结果报告为PDF
- 使用logP和pKa的实验值训练模型,以改善对专有化学空间的预测chemical space
- 创建并选择不同的训练库进行计算,或切换到内置算法
Deployment/Integration Options
选择适合您的部署选项
桌面版
在单台计算机上安装ACD / pKa以访问客户端,该客户端提供完整的图形用户界面和算法训练工具的访问权限
批量版
用最少的用户干预即可计算成千上万种化合物的pKa。批处理部署与Microsoft Windows和Linux操作系统(OS)兼容。企业内部网或工作流工具(例如Pipeline Pilot)的插件。
Percepta Portal网页版
使用基于浏览器的应用程序来预测pKa。可以使用KNIME集成组件。托管在您的公司Intranet或云上。适用于Linux和Windows OS。
More Reasons to Use LogD
有关分配系数预测的技术信息
可训练的LogD计算器
通过训练底层的logP和pKa模型来训练logD算法。提高预测精度并扩大模型在新型化学空间中的适用性。
如何计算logD值?
分布系数(logD)是两相(辛醇和水性缓冲液)的每相中所有形式的化合物(中性和离子化)的所有浓度之和的比率。每种形式在水性缓冲液和正辛醇之间分配的趋势不同。其特征在于与pH无关的分配系数logP物种(例如,logP0,logP-,logP2 +等)。
logD预测算法基于logP的碎片算法(中性形式)和一系列校正因子来计算分配常数,同时考虑电离的类型和位置。 LogD是所有分子种类分布的函数,由pKa预测的pH值控制.
ACD / LogD提供了各种用于预测logP和pKa值的算法,并且可以选择(并将它们的默认组合)用于预测logD。
有关LogD的一般信息
什么是分配系数?
分布常数(D),也称为表观分配系数,是可电离分子的亲水性(“偏爱水”)或疏水性(“偏怕水”)的量度。它代表了化合物在两个不混溶相(通常是辛醇和水性缓冲液)中差异溶解的趋势,同时考虑了基于pH值的离子化物质的分布。也称为分布系数。例如,请参见甲胺在辛醇-水中的分配以及分布常数如何描述该分配:
LogD预测模型将分布常数估计为对数比(logD或ClogD)。分布系数充当可电离化合物的亲脂性(或疏水性)的定量描述。
如何使用logD值?
药物发现-LogD值用于了解和预测活性化合物在生理条件下的体内行为。由于整个胃肠道的pH环境差异很大(从胃中的1.4到结肠中的8),了解药物在生理条件下的亲脂性/亲水性有助于科学家了解在实质上不同的化学环境下的行为。
LogD值在色谱方法开发中也很重要(用于选择合适的pH和分离柱);在农业化学中开发除草剂和杀虫剂;在环境化学中了解污染物的行为,并在许多其他消费产品的开发中。
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