MPQ模块在CHO细胞蛋白组学中的研究进展

前言

INTRODUCTION

在生物制药开发过程中，对中国仓鼠卵巢 (CHO) 细胞进行蛋白质组学研究，在药物纯度验证和分析中是至关重要的。全新的多蛋白定量 (MPQ module) 质谱分析工作流程工具将使生物制药研发各个阶段的蛋白质科学家受益。MPQ模块中包含的不同workflow提供了一个全面的框架，可快速鉴定和定量分析复杂CHO混合物中的数千种蛋白质，并采用以蛋白质为中心的高效布局。这个方法简化了从早期细胞系开发到最终分析阶段的流程，最终提高了生物制药开发中蛋白质分析的整体效率和可靠性。

检查视图以及自动生成的报告，可通过分析质谱仪的精度、分辨率和酶消化效率，快速评估样品制备质量。

(A) 在等量CHO细胞（包括重复样品）混合的样品中，检测到分子量为6,000至83,000道尔顿的人类蛋白质（每种5 pmol）。相对蛋白质丰度（以百分比表示）反映了CHO蛋白质组实验中，仪器检测和软件识别的差异。

(B) 将48种人类蛋白质的相同复杂混合物制备成浓度动态范围从500 pmol到50 pmol的样品，在与50 pmol CHO蛋白质组（包括重复样品）混合的样品中，也检测到了46种蛋白质，且浓度范围较大。结果表明，仪器检测和软件识别的动态范围符合预期。

(A) USP1样品的倍数变化范围为2到4，表明从单次采集到分馏数据采集条件，丰度显著增加。

(B) 在USP2样品中，大多数检测到的蛋白质的倍数变化范围为-6到+4，这反映出分馏采集的丰度变化比单次采集的丰度变化更大，这表明由于复杂样品中的离子抑制效应，分馏可以提高检测灵敏度。