August 2025

  8月的太阳晒得正毒，立秋的日子却悄悄的到了，如此绝佳的契机，ProteinMetrics在上海举办了第一届的实操班。尊敬的您，双手空空的来，脑袋满满的回，我们不负光阴不负卿。 形式上，我司采用了预装配套的软硬件，预拷主题对应的Demo data，对着大屏幕，跟着专家一步步来，从怎么做到为什么这么做的逻辑链梳理，我们渴望分享您未来成功的喜悦。 内容上，本次实操班专注于去卷积模块，从简单的如何人工复核？如何降噪？到复杂的PEG修饰、高异质性样本的合理参数调整，如何正确解读结果，由简如深，加固掌握整套分析思路，我们期待您未来大展宏图。 高级工程师高准在为现场用户进行实操讲解 以下，让我们来看看ACD/Lab资深色谱专家李丹是如何评价的： 早就听说PMI软件的强大，得知8月7号有首场实操班，我第一时间就报了名，满心期待能亲手试试Byos分子量去卷积模块。 可作为纯门外汉，开场前总在嘀咕“能跟上吗”。没想到体验会从软件下载安装就透着贴心——步骤简单明了，配套资料也写得细致。高工登场更是惊喜，不仅技术扎实，操作演示行云流水，全程带着温和笑意讲解，四个案例从基础到复杂层层递进，把Byos的使用逻辑拆解得清清楚楚。 更意外的是还有精致茶歇和伴手礼，大家都觉得既学透了软件用法，又收获了轻松愉悦的心情。这场体验会，不仅让用户感受到专业，更感受了PMI中国团队服务用户的温度。 （ 左右滑动查看更多精彩瞬间 ） 我司着力于为各位用户提供有温度的持续性成长方案，下一期，我们将围绕肽图模块展开，由衷欢迎尊敬的您留言告诉我们您想拆解的难题。 扫码留言 http://proteinmetrics.mikecrm.com/iGH6n5g 关于 Protein Metrics Protein Metrics LLC是一家全球领先的质谱数据解析软件供应商，公司总部位于美国波士顿。我们为科研和企业用户提供高效准确的一站式质谱数据解析方案，帮助用户发现、解决问题。Protein Metrics在全球范围内提供销售和支持，目前已为超过200个企业和300个科研单位提供服务。 联系我们邀约演示 王蕾   13482181958

  含有非天然氨基酸的多肽药物在近年来发展迅速，通过引入非天然氨基酸可以增强药物的稳定性、活性或药代动力学性质。 Byonic可以通过使用固定修饰重新定义单字母氨基酸缩写，来支持有限数量的非天然氨基酸残基设定。从2.9.77版本开始，Byonic接受FASTA蛋白质数据库中的B、Z、U、O、J和X。 非标准氨基酸的质量如下： 例如，针对羟脯氨酸，可以通过在J上添加一个固定修饰：+13.04768，来实现FASTA数据库中的J具有113.04768的质量，代表了羟脯氨酸。 接下来，我们再实际看一个操作案例： 以司美格鲁肽为例，其氨基酸组成为：H-Aib-E-G-T-F-T-S-D-V-S-S-Y-L-E-G-Q-A-A-K(Octadecanedioic acid)-E-F-I-A-W-L-V-R-G-R-G-OH，其中关键修饰包括第2位α-氨基异丁酸（Aib）替换以及第26位通过侧链连接的C18脂肪酸衍生物。 在设置参数之前，我们需要对目标分子的序列做下分析，2号位上天然GLP-1的Ala被替换为Aib，并且在18、19、24位上还存在天然的Ala，故，可以考虑将2号位上的Aib用软件支持的特殊字符中的J进行替换，并在后续的参数设置中，进行分子量为-14.947236（计算逻辑：A残基的精确分子量是：71.037114；甲基化修饰分子量是：14.015650；两个和为：85.052764；J残基精确分子量是：100；J残基上固定修饰为：85.052764-100= -14.947236）的固定修饰设置，最终实现总分子量与Aib的一致。而26位上的Lys侧链共价连接C18脂肪酸二酸链，由于整个序列中只有一个Lys，故，我们可以直接将其定义为固定修饰，无需进行特殊字符的定义。 综合上述分析结论，Fasta中的序列信息将修改为：HJEGTFTSDVSSYLEGQAAKEFIAWLVRGRG，并在后续软件的sequences中，直接将此fasta导入或手动Add row输入都可。 完成序列设定后，我们需要在Processing nodes中的Modifications里进行进一步的参数调整： 先复制Modifications红框中的修饰设置格式，再点击上述红圈中…处，在custom modification text中，粘贴上步操作中的修饰格式，接着，将名称、分子量及位点修改成与目标分子序列一致即可，具体见下图红框处。 总结 软件中的B、Z、U、O、J和X为用户提供了一定数量非天然氨基酸编辑的区间，在何种环境下选择使用或多种同时使用，需要分析人员对目标分子的序列有一定的理解，并需注意特定字符代表的是其氨基酸残基的分子量，使用时同样也需要分析人员在计算分子量的时候注意有脱水的计算过程。在合理的情况下进行分配和使用，将大大的提升可操作性及分析速度。 END 关于Protein Metrics Protein Metrics LLC是一家全球领先的质谱数据解析软件供应商，公司总部位于美国波士顿。我们为科研和企业用户提供高效准确的一站式质谱数据解析方案，帮助用户发现、解决问题。Protein Metrics在全球范围内提供销售和支持，目前已为超过200个企业和300个科研单位提供服务。 联系我们邀约演示 王蕾   13482181958

引言 mRNA药物质量属性 (PQAs) 的表征分析对于确保其安全性和有效性至关重要。利用LC-MS/MS技术进行酶解寡核苷酸序列映射，能够在单一实验中同时表征5’端帽子结构、寡核苷酸序列以及3’端多聚腺苷酸尾巴。 方法 1 eGFP的mRNA经hRNase4酶解后，采用IP-RPLC-MS技术进行分析。 2 实验使用Phenomenex bioZen2.6 µm Oligo 150 x 2.1 mm色谱柱 (PN：00F-4790-AN)，采用70分钟的离子对反相液相色谱梯度洗脱程序，并在Thermo Q-Exactive Plus质谱仪上以DDA负离子模式进行检测。 3 数据处理则使用Byos Digested Oligonucleotide和Oligo软件(V5.6)完成。 图1. hRNAse4酶解eGFP的总离子流色谱图(TIC) 图2. eGFP和mRNA的序列覆盖图 图3. 四种寡核苷酸异构体的二级质谱图及提取离子流色谱图。上方的寡核苷酸表格包含了有助于评估寡核苷酸鉴定结果的列。图表和表格均为Byos Digested Oligonucleotide分析视图的一部分。 结论 寡核苷酸序列比对，5’cap及3’PolyA Tail >99%的eGFP序列覆盖率（见图2）。 Byos软件通过二级质谱 (MS/MS) 自动分配寡核苷酸异构体 (见图3）。IPRP分离对于可靠地分配异构体至关重要。 XIC中的灰色/红色圆点表示异构体的寡核苷酸序列标记物。灰色圆点代表已分配的OSM异构体。（见图3左侧放大图）。 Delta Score: 已分配寡核苷酸与次优得分寡核苷酸/异构体（即异构体的“独特性”得分）之间的二级质谱 (MSMS) 得分差异。 在注释的二级质谱图中观察到的用于区分关键异构体的碎片离子。 图4. 使用Byos报告功能生成的条形图和表格，展示了5’cap各类型的相对丰度（n=3，即样本量为3） m7Gppp 5’cap结构的相对丰度为33.2%，%RSD=1.4% (n=3)。(见图4) 观察到的5’cap结构中间体包括Gppp (占比19%)、ppp (占比1%) 以及pp …

利用酶解寡核苷酸结合IP-RPLC-MS/MS技术对mRNA序列、5’端帽子结构及3’端多聚腺苷酸尾巴进行表征分析 Read More »

本周四下午，Protein Metrics中国团队将在上海举办首场技术路演：分子量专题。资深技术工程师高准将作为主讲人，通过现场演示与实操培训，带您深度解析Byos®软件在复杂生物大分子表征中的前沿应用。 本次路演作为一场售前深度体验活动，无论您正在评估解决方案，还是对下一代生物药表征技术充满好奇，均可在此获得关键洞察。路演现场提供所有设备及预装软件，您无需携带电脑或数据，轻松参与即可！ 席位余量告急，即刻扫码报名! 活动日程安排 01:30-02:15 净化-无artifacts的去卷积分析 适用场景：蛋白质、多肽、Oligo的去卷积分析 02:15-02:30 茶歇 02:30-03:00 降噪-消除单电荷信号的干扰 适用场景：MS1原始数据含有大量校正离子或其他背景干扰 03:00-03:30 梳理-高度多分散分子的还原 适用场景：如常见的PEG化分子，复杂的ADC样本 03:30-03:45 茶歇 03:45-04:30 复刻-保留重度糖基化分子的分布 适用场景：多个糖基化位点的分子 讲师介绍 高准 Sheldon Gao  Protein Metrics 客户成功科学家 参会指南 活动日期 | 2025年8月7日 (星期四) 活动时间 | 13:30-16:30 (13:15开始签到) 活动地点 | 上海市浦东新区祥科路58号炬芯研发大厦A栋2楼215室 👥适合对象： 生物制药企业（抗体/ADC/基因治疗/疫苗）研发/分析/质控负责 CRO/CDMO机构技术专家与管理者 ✅ 参会准备：您无需携带任何设备（现场提供电脑及预装Byos®软件） 报名方式 立即扫描下方二维码或点击链接报名 http://proteinmetrics.mikecrm.com/m9xXwyG 快来锁定您的专属体验席位吧！ 关于 Protein Metrics Protein Metrics LLC是一家全球领先的质谱数据解析软件供应商，公司总部位于美国波士顿。我们为科研和企业用户提供高效准确的一站式质谱数据解析方案，帮助用户发现、解决问题。Protein Metrics在全球范围内提供销售和支持，目前已为超过200个企业和300个科研单位提供服务。 联系我们邀约演示 王蕾   …

即刻抢占席位 | 8月7日，Protein Metrics邀您相约上海技术路演现场 Read More »

Protein Metrics 上海技术路演开放预约 Protein Metrics中国团队将于2025年8月7日 (周四) 下午在上海举办技术路演。本次路演将围绕Byos-Intact模块，针对分子量分析中会遇到的实际困难案例，由技术工程师高准进行系统讲解与演示。 本次路演作为一场售前深度体验活动，无论您正在评估解决方案，还是对下一代生物药表征技术充满好奇，均可在此获得关键洞察。路演现场提供所有设备及预装软件，您无需携带电脑或数据，轻松参与即可！ 活动日程安排 01:30-02:15 净化-无artifacts的去卷积分析 02:15-02:30 茶歇 02:30-03:00 降噪-消除单电荷信号的干扰 03:00-03:30 梳理-高度多分散分子的还原 03:30-03:45 茶歇 03:45-04:30 复刻-保留重度糖基化分子的分布 讲师介绍 高准 Sheldon Gao  Protein Metrics 客户成功科学家 参会指南 活动日期 | 2025年8月7日 (星期四) 活动时间 | 13:30-16:30 (13:15开始签到) 活动地点 | 上海市浦东新区祥科路58号炬芯研发大厦A栋2楼215室 👥适合对象： 生物制药企业（抗体/ADC/基因治疗/疫苗）研发/分析/质控负责 CRO/CDMO机构技术专家与管理者 ✅参会准备：您无需携带任何设备（现场提供电脑及预装Byos®软件） 报名方式 立即扫描上方二维码或点击链接报名 http://proteinmetrics.mikecrm.com/m9xXwyG 席位有限，先到先得 快来锁定您的专属体验席位吧！ 关于 Protein Metrics Protein Metrics LLC是一家全球领先的质谱数据解析软件供应商，公司总部位于美国波士顿。我们为科研和企业用户提供高效准确的一站式质谱数据解析方案，帮助用户发现、解决问题。Protein Metrics在全球范围内提供销售和支持，目前已为超过200个企业和300个科研单位提供服务。 联系我们邀约演示 王蕾   …

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摘要 现代生物治疗分子的分子量大小和异质性给分析流程带来了独特的挑战，需要新颖的分析和计算方法来准确表征和定量复杂的生物制剂。 Intact Mass的渐进解卷积结合多维特征检测，能够稳健地满足此类需求。 1 引言 随着复杂的生物分子结构进入生物制药流程，需要先进的分析方法来评估其组成和质量。完整分子量解析(Intact Mass) 是此类分析的标准方法。 当与电荷和同位素解卷积相结合时，完整质谱可以提供样品中所有独特的质量信息。当在色谱图的连续时间范围内迭代执行（我们称之为“渐进解卷积”）时，可以辨别共洗脱物质，并根据其洗脱曲线区分异构体。 在此，我们详细介绍了将保留时间与电荷解卷积相结合的方法，以对分子量较大的复杂生物样本质量组成进行剖析。 2 方法 用于分子量大的特征发现中的渐进解卷积 利用渐进解卷积进行分子量大的特征检测的工作流程始于对色谱图短而固定宽度且重叠的片段进行采样(a)。从这些迹线片段解卷积得到的质量候选物(b)被转换为质量-时间矩阵，多维分段提供了独特的分子量洗脱时间(c)。随后对提取的质量色谱图进行峰分割，可识别洗脱物质的峰边界，如果存在异构体形式，也可以进行区分。结果在用户界面(d)中进行整合和可视化。 3 结果 高度异质性生物制剂的鉴定与定量 抗体药物偶联物(ADC)通常在色谱图的一个紫外(UV)或总离子流(TIC)峰下以偏移混合物的形式洗脱。在这里，我们捕获了不同量的DM1*有效载荷和MCC**连接子的Trastuzumab emtansine ADC(Kadcyla, Genentech)，提供了稳健的药物与抗体比率计算。 *DM1=(N(20)-deacetyl-N(20)-(3-mercapto-1-oxopropyl)-maytansine) **MCC=succinimidyl-4-(N-maleimidomethyl)cyclo-hexane-1 carboxylate 脱酰胺、异构化、琥珀酰亚胺形成和糖基化（包括唾液酸）是常见的抗体电荷变异修饰，会导致样本的高异质性，这些变异可以使用弱阳离子交换(WCX)-MS在完整水平上进行监测。上述样本结果显示了未应激的Herceptin单克隆抗体的各种形式。 即使糖基化位点数量很少的生物制剂，如果每个糖基化位点存在微小异质性，也可能产生显著的异质性。如，对具有4个糖基位点并考虑9种可能聚糖的II类主要组织相容性复合物进行分析，可识别出数百种糖型及其洗脱曲线。 https://doi.org/10.1038/s41467-024-47693-8 作者 Gary M. Wilson1, Tong Ding2, Aaron O. Bailey2, and Ignat Shilov1 1 Protein Metrics LLC, Boston MA USA; 2 AbCellera Biologic Inc., Vancouver BC CAN END 往期推荐 MPQ模块在宿主细胞蛋白(HCP)表征中的进展 …

用于大分子质谱分析中特征检测与定量的专用计算方法 Read More »

7月11日-12日，QbD2025第六届生物药质量科学大会于北京朝阳万达文华酒店圆满落幕。作为全球领先的质谱数据解析软件供应商，Protein Metrics携核心技术亮相A54展台。在这场以“质取工艺，设计未来”为主题的前沿盛会中，我们与行业同仁共探重组蛋白、ADC、抗体药、细胞基因治疗等领域的质量科学突破，收获满载！ 展台直击 专业共振 1 精彩互动 A54展台前人流如织，Protein Metrics中国区经理王蕾和技术工程师高准正在与专家、负责人围绕质谱数据解析在生物药开发中的加速价值展开深度交流。 2 方案全覆盖 现场展示的Byos®统一生物表征平台引发高度关注，其覆盖多蛋白定量、肽图深度解析、分子量分析、高级结构研究等一体化解决方案，精准呼应大会“质量源于设计”理念。 现场精彩瞬间 技术专家讲解Byos®实时数据处理流程  展台展示（左：Protein Metrics中国区工程师高准    右：Protein Metrics中国区负责人王蕾） 资料领取 & 专家讲解 未来启程 质量科学 感恩所有莅临A54展台的伙伴！ Protein Metrics将持续深耕质谱驱动的生物药智能表征领域，以更强大的Byos®平台以及更敏捷的解决方案助力生物制药领域的发展！ 即刻获取展会精华资料 关注Protein Metrics公众号 点击菜单页“产品介绍”深入了解产品详情 关于 Protein Metrics Protein Metrics LLC是一家全球领先的质谱数据解析软件供应商，公司总部位于美国波士顿。我们为科研和企业用户提供高效准确的一站式质谱数据解析方案，帮助用户发现、解决问题。Protein Metrics在全球范围内提供销售和支持，目前已为超过200个企业和300个科研单位提供服务。 联系我们邀约演示 王蕾   13482181958