February 2024

Report界面简介

Report界面简介 Protein Metrics 高准 “一千个读者眼里有一千个哈姆雷特”, 这句谚语同样适用当今的生物大分子分析结果呈现中,随着分子设计越来越复杂;不同目的的情况下,关注的内容不尽相同,固定格式的报告已经无法满足相应的需求,手动编辑报告便成了“宇宙的尽头”,令人苦不堪言。 Byos中的report编辑界面可以从一定程度上帮助用户减少这样的无效劳动,丰富的自定义功能,支持一次编辑享用整个“生命周期”,解放双手的同时,咱干点能涨“绩效”的活儿不好嘛?~ —— Protein Metrics 王蕾 摘要 Byos提供高度灵活性的报告格式,允许快速出具报告;设计针对性的报告模板,满足多样化需求;支持自定义脚本,方便个性化调整。 软件自动计算DAR值,修饰百分比等关键质量属性;可进行统计学分析,通过图表可视化呈现。分子量和肽图采用相同的归一化策略,多维度给出定量信息。 在这里,用户可以报告任何想要报告的内容。 本文主要从数据透视表的角度来介绍,包括报告排版,自定义修改,归一化以及修饰百分比。 01 报告排版 Byos的报告排版主要由两部分组成,分别是视图类型和动态列表,如图1所示: 图 1 数据透视表排版 视图类型决定数据呈现方式,Byos提供多种选择,如PCA,热图,火山图,条形图等。 动态列表给出数据细节信息,如名称,序列,分子量,保留时间等。 行字段和列字段均是从动态列表手动拖拽至此,这些数据无法进行后处理。通常行字段显示样品名,样品类型等样本信息;列字段显示蛋白质名称,翻译后修饰等变量信息。 结果与动态列表的字段信息完全一样,区别是此处数据可进行后处理,可计算平均值,相对标准偏差,P值等。 02 自定义修改 字段颜色 通常字段默认是黑色字体,红色字体表明数据被排除或者隐藏,如图2所示: 图 2 红色字段特征 复选框未勾上表明数据就被排除或隐藏。排除意味着数据不会纳入最终的计算,也不显示;隐藏表示数据已经计算,只是在当前视图不显示。 注意:如果您发现定量结果不合理或者信息展示不全,请先查看有没有红色字段。 数字格式 01 结果数字格式修改 Byos提供各种计数方法,包括数字,百分数,科学计数法等。可按照图3所示进行修改。 图 3 结果数字格式修改 02 字段数字格式修改 点击对应字段,找到数据格式,直接修改,如图4所示: 图 4 字段数字格式修改图 03 归一化 数据归一化处理得到相对含量,不同的归一化水平给出不同维度的结果。 以归一化到列为例,系统介绍如何解读相对定量结果。归一化水平取决于当前所选列数量,如图5所示: 图 5 归一化水平 …

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用于多聚糖和肽图分析的自动化数据处理:利用Byos® 提高效率与质量

用于多聚糖和肽图分析的自动化数据处理 利用 Byos® 提高效率与质量 特此感谢: –  Thomas Powers(辉瑞公司) –  Protein Metrics Customer Success Team(美国加利福尼州库比蒂诺) PART/1 摘要 本技术简介阐述了如何将来自不同实验的正交信息结合在一起以进行生物制剂表征 生物治疗药物管线的变化意味着拥有面向未来的 LCMS 工作流程平台非常有利 实现分析自动化可有效减轻质谱专家的工作负担,同时保持结果的一致性。 PART/2 前言 过去面临的与多聚糖和 肽图分析相关的挑战 1. 耗时:选择峰并与理论多聚糖/肽质量数匹配的过程繁琐,需要手动进行 2. 即使存在 MS/MS 数据,也难以利用。目前,主要基于 MS1 进行分析 3. 这种技术容易出现手动输入错误(例如,手动输入分子量、错误标注峰等)。 4. 峰归属未采用一致的阈值,导致不同分析人员得到的结果存在主观性 5. 难以验证数据,并且需要验证的数据量非常大 通常,当自动化作为一个课题提出时,其重点主要在于提高效率,但基于软件的自动化还能够同时改善结果的质量和一致性。 生物药物产品表征先前主要依赖于多种分析,包括肽图分析、亚基分析、游离多聚糖分析和完整分子量分析。最近,其他技术提供了对产品更全面的了解,这些技术包括序列变异体分析(SVA)、宿主细胞蛋白表征(HCP)、热点分析(Hotspot)。通过使用MAM 和其他增强表征筛选方法,质谱技术也越来越多地应用于生物工艺和配方支持。 随着分析次数的增加,越来越多的样品以及愈发复杂的分析方式有待研究。 在这种情况下,手动数据处理已经不足以满足需求,因此需要借助自动化数据处理与报告以确保效率、质量和一致性。 PART/3 实验条件 样品处理和分析 对于肽图分析,使用 Lys C 对抗体样品进行酶解,然后进行反相 HPLC-UV-MS 分析。 对于多聚糖分析,使用 PNGaseF 对抗体样品进行 …

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