宿主细胞蛋白(HCP)分析应用文集
宿主细胞蛋白 (HCP)分析应用文集 Protein Metrics 前言 在生物制药行业中，随着仪器和样品制备技术的不断改进，利用质谱 (MS) 发现、分析和监测宿主细胞蛋白 (HCP) 似乎是一个日益增长的趋势。本技术说明介绍了使用 Byos™（传统 Byonic™ 和 Byologic®）确定 MS/MS 数据中 HCP 的方法。本工作流程提供了聚焦于搜索 HCP 和其他类型蛋白质污染物的处理参数和报告模板。 01 配置工作流程 01 蛋白质数据库 用户提供一个 FASTA 文件，其中含有表达该蛋白的生物体的蛋白列表。例如，如果样品在中国仓鼠卵巢 (CHO) 细胞中表达，则可以使用来自“organism:Cricetulus”的蛋白质数据库。我们建议在该数据库中附加表达培养基蛋白（例如牛源性蛋白），包括纯化蛋白的序列，以及在纯化过程中使用的消化酶和其他试剂（例如蛋白 A）。 02 重复分析 如果数据包含重复项，则使用正确的“Samples Name”（或“MS Alias name”）描述可以帮助 Byos 获得统计数据，可显示在表格或条形图中。设置示例如下所示，其中，“s(…)”代表样品 (sample)，“r(…)”代表重复 (replicate)。 03 MS/MS 搜索（传统 Byonic™） Byos HCP 工作流程中的第一个处理节点是 Byonic 进行的 MS/MS 搜索。 搜索 HCP 分析的目标是尽可能地进行蛋白鉴定。HCP 分析的默认参数如下： …