数字化实时分析系统使高通量大分子筛选成为可能
Introduction 通过准确和快速的分子量水平的高通量质谱分析，在小分子、多肽和小蛋白的研发过程中是非常重要的一环。Sawyer 等人近期在PNAS（2020, 117, 9851-9856.）上证明了高通量质谱分析在抗体药物中的可行性。基于这项工作的推动，我们开发了一个完整的端到端 (E2E) 的管道，将 RapidFire-MS (RF-MS) 数据采集与生物制剂的实时信息学和数据相结合。实现了，我们可以整合生产、分析和信息学的内容，通过简化硬件和数据自动化分析来筛选完成例如>103~104个大分子的工作。我们将在下文中展示该方案和传统分析及现有生物信息学相比的优点。 Methods Figure 1. 用于生物制剂筛选的 RapidFire 自动化高通量平台的结构。 01 LIMS系统支持样品检索 02 使用 MARS 机器人技术和自动化工作站进行Protiein A的纯化（未来状态） 03 RapidFire–质谱数据采集 04 服务器数据存储 05 自动将数据扫描至 Byosphere 平台，并配置分子量自动分析工作流 06 自动导出结果并联合报告复核 07&08 汇总数据与分子信息，以构建“内部”知识库（也是自动化“QC”） Results and Discussion Figure 2. RF-MS系统可用于典型的大分子（例如抗体）分析。 (A) 该系统可以实现每个样本的数据采集速度快至 5 秒。使用metadata匹配样品 ID 和对应在孔上的位置。(B) 高通量分析获得高质量的原始 MS 数据。 (C) 使用Byos完整质量去卷积算法对精确分子量进行去卷积。 Figure 3. 通过 RapidFire 进行快速亚基糖型分析。 (A) …