April 2022

单抗药物从头测序的应用案例分享

抗体从头测序在生物制药行业的应用范围从发现新的抗体候选药物,到鉴定用于研究的试剂,以及确定用于生物仿制药开发的创新产品的一级结构过程中都是极其重要的。并且,抗体分子本身的一级结构,特别是其CDR区域的氨基酸序列是发挥其生物学功能的核心,对其完整序列准确快速的分析具有十分重要的意义。 在过去,Edman降解以及Edman降解与质谱法的结合已经普遍地用于确定完整的蛋白质序列。如今,有许多算法和软件包可用于在肽水平上基于纯质谱的从头测序,这些算法使用MS/MS碎片数据和每个肽的前体离子质量的组合来预测推定的肽序列。同时,一些软件包通过将从头测序的肽段信息与蛋白质组数据库搜索相结合,能够将已识别的肽段匹配到同源序列上,从而完成蛋白的从头测序的工作。 然而,抗体序列的多样性对上述肽从头测序和数据库匹配策略提出了更高的要求。不同的抗体序列针对特定抗原都会进行微调,来最大限度地提高蛋白质与蛋白质间相互作用。并且,每个免疫反应都会产生独特的序列,而这些序列在蛋白质组数据库中无法得到注释。 今天,小编为大家带来了Symphogen公司首席科学家:Dan Bach Kristensen在抗体从头测序中的实际案例。案例中使用了单克隆抗体从头自动测序的新算法Supernovo™(Protein Metrics Inc.)。该算法中囊括了肽从头测序、蛋白质组数据库搜索、抗体编码外显子的计算机重组以及从已识别肽的最终序列组装的组合,以自下而上的蛋白质组学策略对单克隆抗体进行自动测序。 分享节选 完整视频 已关注 关注 重播 分享 赞 关闭 观看更多 更多 退出全屏 切换到竖屏全屏退出全屏 ProteinMetrics已关注 分享视频 ,时长06:17 0/0 00:00/06:17 切换到横屏模式 继续播放 进度条,百分之0 播放 00:00 / 06:17 06:17 全屏 倍速播放中 0.5倍 0.75倍 1.0倍 1.5倍 2.0倍 超清 流畅 您的浏览器不支持 video 标签 继续观看 单抗药物从头测序的应用案例分享 观看更多 转载 , 单抗药物从头测序的应用案例分享 ProteinMetrics已关注 分享点赞在看 已同步到看一看写下你的评论 视频详情 …

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Byos v4.4新功能线上演示会圆满完成

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Webinar: Byos更新介绍

点击文末“阅读原文”即刻报名 各位尊敬的Protein Metrics用户,Byos已在3月更新至最新版本v4.4,涉及的模块为:Byonic™、Peptide Analysis (Byologic®), Chromatogram Analysis (Byomap™), Intact Analysis (Intact Mass™), Supernovo™, Footprint™, 和Preview™。 鉴于目前全国疫情仍旧严峻,Protein Metrics中国将于4月18日14点举办一场Byos V4.4 更新介绍线上会,期待与您“云”上相约。   课 程 内 容 更新综述如下: Byonic™ 对二级质谱图的自定义阈值设定,可进行数据过滤。 靶向蛋白与相似序列污染物肽段的搜索功能开通。 Peptide Analysis(Byologic®) Processing nodes 窗口命名重命名。 Unify API (by waters) 的DDA数据已可直接导入byos 中的peptide 模块。 Xlinking 信息可直接在peptide模块中查询阅读。 蛋白的分子量、等电点信息已添加如覆盖率阅读窗口。 ChromatogramAnalysis (Byomap™) 样本对比界面增加质谱数据添加参考功能。 增加支持直接导入Peptide模块中的Xlinking 信息功能。 增加二硫键和非二硫键修饰的注释功能。 增加通过自定义保留时间参数确认糖链信息功能。 增加自定义修饰功能。 Intact Analysis(Intact Mass™) 用户界面更新,可提供多个峰的同时分析。 增加了可设定超过理论分子量20%的自动匹配功能。 …

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