Byos 未知峰鉴定及同位素分辨的去卷积功能
本期Protein Metrics Insights的主要内容： (1) 利用In-Silico peptides功能提取一级质谱(MS1)的XIC峰面积； (2) 最新版本Byos V3.7中同时标注去卷积完整谱图中的单同位素分子量和平均分子量。 1. 高级功能 In-Silico Peptides 在默认情况下，Byos大多数肽谱分析流程只对根据MS2谱图匹配到的肽段进行定量分析。有些时候，分析人员也会需要对没有MS2谱图匹配的肽段进行定量。这种情况可以用我们软件的in-silico peptides 功能实现。从广义上来说，in-silico是提取肽段XIC谱图的一种方式。这样即使MS2谱图缺失或者质量差的时候，也可以对肽段进行一致的定量。由In Silico鉴定到的肽段可以通过In Silico列中的“Yes” 标记很容易地与其他MS2鉴定到的肽段区分开。 Automated In-silico Generation via a Theoretical Digest（通过理论酶切自动生成In-silico肽段）: 在创建项目的过程中，软件根据设置的In-silico酶切来生成包含所有预期肽段的列表。理论酶切允许用户查看和编辑修饰列表以满足不同的实验方法。 CSV In-silico Import（导入In-silico肽段的CSV文件）: 项目创建过程中或者项目结束后，都可以导入包含In-silico肽段的CSV文件。 Add Missing via Existing（通过已有的肽段添加缺失肽段）：在一个项目某些文件中找到的肽段，系统可以自动在其他文件中寻找相同肽段的信息。 Create New Peptide from Current（由当前肽段创建新肽段列表）: 在当前已有肽段的基础上生成in-silico列表，可用于添加额外的电荷态和异构修饰。 With the introduction of our new Feature Finder tool（引入新的Feature Finder工具）:用户可以对之前未鉴定的峰进行In-silico鉴定。 打开In-Silico Peptides分析功能的方法是： 在Workflow中的Processing nodes标签页中，找到“In-silico …