非天然氨基酸的设定操作

Byonic可以通过使用固定修饰重新定义单字母氨基酸缩写，来支持有限数量的非天然氨基酸残基设定。从2.9.77版本开始，Byonic接受FASTA蛋白质数据库中的B、Z、U、O、J和X。

例如，针对羟脯氨酸，可以通过在J上添加一个固定修饰：+13.04768，来实现FASTA数据库中的J具有113.04768的质量，代表了羟脯氨酸。

综合上述分析结论，Fasta中的序列信息将修改为：HJEGTFTSDVSSYLEGQAAKEFIAWLVRGRG，并在后续软件的sequences中，直接将此fasta导入或手动Add row输入都可。

完成序列设定后，我们需要在Processing nodes中的Modifications里进行进一步的参数调整：

先复制Modifications红框中的修饰设置格式，再点击上述红圈中…处，在custom modification text中，粘贴上步操作中的修饰格式，接着，将名称、分子量及位点修改成与目标分子序列一致即可，具体见下图红框处。

软件中的B、Z、U、O、J和X为用户提供了一定数量非天然氨基酸编辑的区间，在何种环境下选择使用或多种同时使用，需要分析人员对目标分子的序列有一定的理解，并需注意特定字符代表的是其氨基酸残基的分子量，使用时同样也需要分析人员在计算分子量的时候注意有脱水的计算过程。在合理的情况下进行分配和使用，将大大的提升可操作性及分析速度。