解析糖肽搜库结果

首先根据肽段对结果进行排序，再根据保留时间进行排序。您可以将肽段的电荷态Combine，看看其分布是否符合预期？

查看肽段组的聚糖是否与某个合理的构建途径相关？糖肽的保留时间是否合理？

检查那些归属不明确的MS2，以确保分配了正确的聚糖。糖基化的肽段往往会导致肽骨架的碎裂效果不佳，因此仅依靠打分来进行解析可能会忽略掉一些真正的阳性谱图。因此，通常需要对MS2质谱图进行手动解析。

聚糖生物学意义

糖肽保留时间

在大多数糖肽的碰撞MS2质谱中，您应能看到 HexNAc (204) 和 HexNAcHex (366) 的信号。如果您没有看到这些碎片，但是鉴定结果包含这些结构单元，可能就不是糖肽。

确保肽段的N端和C端正确。如果末端不正确，那么一个被认为是截短的肽段可能实际上是一个全长肽链，只是携带了不同的糖基修饰。寻找覆盖末端的 b/y 离子；或者携带小聚糖碎片的完整肽，在合适的能量下进行HCD/QTOF碎裂，Y0和Y1均为可靠的峰。

仔细检查Delta Score较低的谱图，因为这表明Byonic找到了另一种不同的匹配结果。

请注意标有波浪号（例如 ~y5）的碎片，这表明这些碎片已经完全丢失了聚糖（或其他不稳定的物质）。虽然这是合理且预料之中的，但在缺乏其他确认信息的情况下，这也有助于定位糖基化位点。