如何在Byos中修改聚糖命名法和添加卡通图

第一步：正常创建项目，选择合适的参数进行设置，点击Create Project，完成数据的分析步骤，得到下图可视化界面及报告界面。

图1

图2

第二步：在图1的分析界面中，首先进行数据筛选，选择需要在报告中展示的信息，例如只关心糖肽，通过下图🔍选项，进行Glycosylation的筛选。

图3

第三步：调取Pre pivot column。

图4

第四步：将调取出的Glycan Short Name的表头columns拖拽至展示columns中。

图5

第五步：报告中自动添加Glycan short name信息。

图6

第六步：修改命名法和添加未收录的糖型。

A：打开Glycan short name脚本，点击✏处

图7

B：将红色方框内生物制药名称替换成牛津名称

图8

C：添加未收录糖

图9

D：更新report，可看到更新后的聚糖名称

图10

第一步：查看卡通图。

图11

第二步：如果没有看到卡通图，说明软件没有收录，需要手动添加。

图12

网址: https://glyconnect.expasy.org/browser/structures

图13

第四步：添加新卡通图。

图14

第五步：IUPAC命名法中含有单糖的连接方式，如上图所示β 4（表示β 1，4糖苷键，1往往会省略），α ? （表示α 1，?糖苷键，?表示未知位点）等。如果不想显示连接信息，可以删除IUPAC名称中括号内的字符。

图15

第六步：选中新添加的糖卡通图，更新report。

图16

Byos软件收录大量的pre和post pivot脚本，允许用户自定义添加和修改，从而设计专属的个性化报告模板。